针对问题:针对问题武汉公交16年司机，公司文件说有三起A类行车违章开除怎么办？

处理方式：
从法律角度，针对此类问题，常见的处理方式包括与公司协商、申请劳动仲裁和提起法律诉讼。
选择建议：首先尝试与公司沟通，了解开除决定的具体依据，并表达个人意见。若协商无果，可准备相关证据向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。若劳动仲裁结果仍不满意，可依法向人民法院提起诉讼。
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具体操作：
1. **与公司协商**：主动与公司人力资源部门沟通，要求查看相关规章制度及开除决定的依据，表达个人对开除决定的异议，寻求和解。
2. **准备证据**：收集个人行车记录、公司规章制度、开除通知书等证据材料，确保材料的真实性和完整性。
3. **申请劳动仲裁**：向当地劳动仲裁委员会提交仲裁申请，附上相关证据，详细陈述个人诉求和理由。
4. **参与仲裁听证**：在仲裁听证会上，积极陈述个人观点和理由，对对方证据进行质证。
5. **提起法律诉讼**：若劳动仲裁结果不满意，可依法向人民法院提起诉讼，遵循法院程序，参与庭审，维护个人合法权益。
6. **执行判决**：若法院判决有利于个人，应依法申请执行，确保判决得到切实履行。
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需核实公司文件及A类违章标准，确认开除决定是否合法。
分析：作为武汉公交16年的司机，您有权了解并核实公司关于“三起A类行车违章开除”的具体规定。从法律角度看，公司规章制度需合法、明确且经过公示，且开除决定需符合《劳动合同法》的相关规定，不能违反法律法规的强制性规定。若公司文件未经合法程序制定或内容违法，或开除决定缺乏事实依据，则可能构成违法解雇。
提醒：若公司单方面强行开除，且无法提供充分的事实和法律依据，表明问题已较严重，建议及时寻求劳动仲裁或法律诉讼途径维权。